Projets financés
Exploration multidimensionnelle du transport et de la sécrétion des éxoprotéines par la voie de type II – 4D-SECRETION
Les bactéries pathogènes ont développé d’ingénieuses machineries pour garantir la sécrétion efficace de nombreux facteurs de virulence. Le système de sécrétion de type II est spécifiquement adapté au transport d’exoprotéines sous forme repliée. Nous avons précédemment révélé par des approches biophy
Manipulation du trafic membranaire par des pathogènes bactériens – Bacterial-Tactics
Elucider la structure et les propriétés biochimiques de toxines de bactéries pathogènes qui détournent les petites GTPases cellulaires; analyser leurs interactions à la surface des membranes Nous étudions des protéines de Legionella pneumophila et de Coxiella burnetti dont nous avons déterminé les
Mieux comprendre les stades précoces et tardifs de l’assemblage des noyaux Fe-S dans la mitochondrie – FRATISCA
Objectif 1: Obtenir une vision intégrée des mécanismes moléculaires dans l'étape initiale mitochondriale de l'assemblage des noyaux Fe-S. En particulier, nous cherchons à déterminer le rôle de la frataxine lors de la formation des noyaux Fe-S sur ISCU. Objectif 2: Obtenir une vision intégrée du rô
Visualisation et Modélisation de la Mitose Bactérienne – IBM
Le but de ce projet multidisciplinaire est d’utiliser et de développer les nouvelles méthodes de microscopie à fluorescence pour visualiser directement et caractériser de façon quantitative le processus de ségrégation de l’ADN à très haute résolution spatiale et temporelle. Ces mesures, en parallèle
Nanostructures biologiques et synthétiques étudiées par Résonance Magnétique Nucléaire du Solide – NanoSSNMR
La conception de nouvelles architectures, et particulièrement l'optimisation de leurs propriétés, constitue une tâche formidable qui requiert la compréhension des paramètres thermodynamique et cinétique associés avec le phénomène d'assemblage / désassemblage. Les interactions faibles (van der Waals,
Rôle de l'histone H1 et de ses partenaires dans la structure et les propriétés épigénétiques de la chromatine – ChromComp
Notre patrimoine génétique va au-delà de la séquence de notre génome. Notre développement, caractéristiques phénotypiques et fonctions cellulaires dépendent de la façon dont l'information génétique codée par l'ADN est organisé en chromatine dans le noyau. L'unité fondamentale de cette organisation,
Parallélisation massive de la nanoscopie STED pour étudier l'orchestration spatio-temporelle rapide de protéines dans les sites d'adhésion cellulaire – FastNano
Les cellules adaptent l'organisation de leur cytosquelette et leurs propriétés d’adhésion aux changements biochimiques et physiques de leur environnement. Réciproquement, par adhésion et par génération de forces entre cellules voisines ou par la matrice extra-cellulaire (ECM), les cellules contrôle
Interactions protéine-protéine et protéine-ARN au sein du complexe réplicatif du virus de la grippe de type A – RNAP-IAV
En combinant la composante ARN à des outils biologiques par des m’méthodes biophysiques et structurales innovantes, les deux partenaires impliqués dans le projet désirent apporter des réponses à des questions essentielles relatives à la prolifération du virus de la grippe. Les progrès récents dans l
Trm112, un activateur de methyltransférases à l'interface entre la biogenèse du ribosome et sa fonction – TrMTases
L’identification de nombreux facteurs impliqués dans la biogénèse des ribosomes et la traduction ont permis de mieux comprendre ces mécanismes. Ces protéines ont souvent été étudiées de façon isolée par des études structurales et fonctionnelles, même si on sait actuellement qu’elles font partie d’un
Mesure des taux de mutations et des effets de mutations sur le fitness dans des cellules uniques, vivantes, en temps réel – SingleCellMutation
Utiliser la micro fluidique, microscopie time-lapse, et Escherichia coli afin d’étudier pour la première fois directement au niveau des cellules uniques la dynamique d’apparition des mutations spontanées et leurs effets sur fitness. Caractériser en utilisant cette approche et de façon non paramétriq
Révéler les détails conformationnels d’une pompe d’efflux membranaire – BmrA-NMX
Dans ce projet, nous voulons contribuer à une compréhension plus profonde des événements de conformation qui permettent l'exportation de médicaments à partir de cellules par transporteurs ABC. Les questions que nous visons à répondre sont les suivantes : -*Quels sont les résidus clés agissant en t
Analyses structurales et fonctionnelles de deux moteurs moléculaires membranaires présents chez les bactéries à Gram-négatif. – BacMolMot
Le but ce projet est de déterminer la structure de deux complexes membranaires afin de mieux comprendre comment ils transmettent l’énergie à travers l’enveloppe bactérienne des organismes à Gram négatif. Les complexes Tol et Ton conduisent l’énergie de la membrane interne à la membrane externe afin
Asymétrie lipidique des bicouches membranaires: mécanisme moléculaire du transport de lipides et rôle de ce transport dans le trafic membranaire – AsymLip
Les ATPases P4 sont des protéines transmembranaires qui catalysent un transport actif de lipides d’un feuillet à l’autre des membranes cellulaires eucaryotes. Une autre famille de protéines est impliquée dans le transport de phospholipides, les protéines Cdc50. Il a été établi avec certitude que les
Etude fonctionnelle et structurale pour comprendre comment les CDPS détournent des ARNt aminoacylés – CDPS-hijacker
Les propriétés uniques des CDPS en font un sujet d'étude original et ambitieux. De nombreuses questions quant au mécanisme catalytique emprunté par les CDPS et aux bases moléculaires de leurs interactions avec leurs substrats, les aa-ARNt, demeurent sans réponse. De plus, les relations existant au s
Reconstitution de l'interface entre les microtubules et l'actine corticale – ReconstMT-Act
L'interaction entre les réseaux d’actine et de microtubules est essentielle dans de nombreux processus cellulaires, par exemple au cours de la croissance des neurones ou lors du développement des tissus. Des mutations du gène APC, codant pour la protéine "Adenomatous Polyposis Coli" qui module cette
Structure et assemblage des P-bodies – PBODYSTRUC
Une des limitations principales pour comprendre la fonction des P-bodies vient de leur taille réduite et de leur faible nombre, mais aussi de l’absence de protocole de purification. Leurs composants protéiques connus ont été identifiés par hasard ou par essai et erreur, tandis que leur contenu en AR
La maturation des ARNt étudiée par RMN en cellules ou en extraits cellulaires – NMR-VitAmin
L'originalité et le défi de ce projet réside dans l'utilisation de la RMN en extraits et/ou en cellules afin d’élucider certains aspects important de la biosynthèse et de la maturation des ARNt dans les conditions d'une cellule vivante. Notre principal objectif est de réaliser, pour la première fois
Modélisation Hybride Formelle du Temps pour la Biologie des Horloges Circadiennes et la Chronopharmacologie – HYCLOCK
L'objectif général du projet HyClock est (i) d'apporter la preuve de principe que la modélisation hybride surpasse les méthodes classiques pour l'étude des propriétés du systèmes circadien des mammifères et (ii) appliquer cette approche à une meilleure compréhension des connexions horloge circadien
Mécanismes des voies fidèles de tolérance des lésions – GENOBLOCK
Nous avons deux objectifs principaux: 1) Poursuivre l'étude génétique de la tolérance aux dommages de l'ADN et la compréhension des mécanismes moléculaires du DA chez la bactérie. Cette étude nous permettra de mieux comprendre la structure de la fourche de réplication qui rencontre une lésion et par
Imagerie électrochimique fonctionnelle de systèmes enzymatiques multi-composants organisés sur des virus nano-gabarits – eVIRZYM
Ce projet a pour but le développement d’outils expérimentaux innovants pour la conception d’assemblages enzymatique multi-composants organisés sur nano-gabarit et leur étude fonctionnelle à l’échelle du nano-gabarit (nano-système) individuel. Au-delà de la prouesse instrumentale que cela représente,
Combinaison de manipulation optique et mécaniques, de microscopie å haute résolution, et de modélisation physique pour comprendre la signalisation mécanique des cavéoles dans les cellules saines et pathologiques – DECAV-RECAV
La mécanotransduction ou traduction de stimuli mécaniques en signaux biochimiques, a récemment émergé comme un événement clé dans des aspects cellulaires fondamentaux, comme la motilité, la croissance et la différenciation. Comment la mécanotransduction couple la détection des forces mécaniques à de
Un nouveau metallophore dérivé de la nicotianamine chez des bactéries pathogènes – ANIBAL
Assurer la disponibilité d'un métal afin de croitre est un processus microbien vital, particulièrement critique lorsque la source devient rare comme à l'intérieur d'un hôte. Nous présentons ici un projet dédié à l'étude d'un opéron prédit pour coder les différentes fonctions permettant la synthèse,
Connexion mécanique entre le cytosquelette d’actine et le noyau – Actin2Nucleus
Dans les cellules eucaryotes, le noyau est physiquement connecté au cytosquelette, une caractéristique fondamentale pour la transmission des forces mécaniques requises pour de multiples fonctions nucléaires et chromosomiques. Une protéine transmembranaire de l’enveloppe nucléaire, Nesprine-2, intera
Pili de type IV et pseudopili: structure, dynamique, assemblage et fonction moléculaire – FiberSpace
Les microorganismes façonnent leur environnement et la planète grâce à leur capacité à transporter des macromolécules et à assembler des organites permettant la motilité et adhérence aux substrats. Chez les bactéries, les pili de type 4 (PT4) et les systèmes de sécrétion de type 2 (SST2) assurent se
Mécanique de fission membranaire induite par ESCRT-III – ESCRTfission
La base structurelle et fonctionnelle du remodelage par ESCRT-III est peu comprise. Pour comprendre ces processus nous proposons de poursuivre les trois objectifs suivants: 1. Le premier objectif est de résoudre la structure de l'unité récurrente du polymère d’ESCRT-III composé de CHMP2A et CHMP3
Sondes photostables pour la visualisation de protéines avec une haute résolution temporelle – Tag-light
L'étude des mécanismes complexes contrôlant les cellules et les organismes nécessite des systèmes d'imagerie efficaces et des sondes fluorescentes pour observer et quantifier les biomolécules en temps réel avec une haute résolution spatiotemporelle. Une stratégie classique pour imager les protéines
Etudes structurales de complexes ribosomaux contenant des peptides naissants préparés à l’aide de flexizymes – RiboFLEX
Les ribosomes sont d’énormes complexes moléculaires chargés de traduire l'information génique en protéines. Au cours de la traduction, les peptides naissants transitent par un long tunnel de sortie situé dans la grande sous-unité du ribosome avant d'atteindre le milieu intracellulaire. Initialement
Relation structure-fonction d'une famille d'histidine kinases contrôlant le mode de vie de Pseudomonas aeruginosa – REGALAD
Ce projet vise à identifier les bases moléculaires dans le domaine transmetteur H1 de ces quatre GacS/PA1611/LadS/RetS histidine kinases (HK) qui dictent la formation d’homodimères versus les hétérodières et pourquoi l’HK LadS se comporte différemment en ne formant que des homodimères. Ce projet adr