Projets financés
Biologie structurale de la modification et de l l'assemblage de la chromatine – Epistruct
Ce projet a pour but de comprendre l'intégration des signaux sur les promoteurs et comment ces signaux conduisent à une modification de la chromatine, son remodelage et, finalement, à l'activation des gènes. Les mécanismes qui mènent à l'activation des gènes sont à la base des circuits complexes. Il
Exploration fonctionnelle et structurale d'une nouvelle famille de protéines à activité RNase P – PRO-RNase P
La découverte et la caractérisation de ce nouveau type de RNase P protéique est très récente. Ainsi, la recherche proposée vise à étudier de manière beaucoup plus approfondie la fonction et le mode d'action des nouvelles RNase P protéiques. Cette recherche sera multidisciplinaire. Par des approches
Mécanisme de biosynthèse de protéine dans procaryotes et eucaryotes étudié par analyse des rayons X. – SSOTR
Notre étude permettra d'améliorer nos connaissances du ribosome - principale usine cellulaire responsable de la fabrication des protéines. Par la suite, ces travaux permettront de nous rapprocher de l'objectif final à savoir la compréhension du ribosome humain, sa structure et les détails biochimiqu
Assemblage moléculaire du pilus chez S. pneumoniae. Exploitation biotechnologique d’une boîte à outils conçue par la nature – PILIPATH
Streptococcus pneumoniae est responsable de la majorité des pneumonies, otites, sinusites et meningitis causant près de 1,6 millions de décès par an. Les moyens de lutte vaccinaux et thérapeutiques contre ces infections deviennent inefficaces. Les facteurs de virulence du pneumocoque exposés en surf
Déterminants structuraux de l'infectivité de phages lactococcaux de la famille des Siphoviridae – Lacto-Phages
Les phages à queue (Caudovirales) appartiennent à trois familles, parmi lesquels les Siphoviridae possèdent une longue queue non contractile terminée par une pointe ou une plaque basale servant à l'adsorption des phages sur leur hôte. Bien que le mécanisme de l'infection bactérienne par les deux aut
L’Orange Carotenoid Protein : une protéine photoactive impliquée dans la photoprotection chez les cyanobactéries – CYANOPROTECT
L’ambition de ce projet est de créer un réseau multi-disciplinaire et international de laboratoires de tout premier rang mondial capable de résoudre le mécanisme de photoprotection chez les cyanobactéries, d’élucider le photocycle d’une nouvelle protéine photoactive et de comprendre plus profondémen
Machinerie de fusion des rhabdovirus – MAFUR
L'objectif de ce projet est d'obtenir une compréhension détaillée au niveau moléculaire des mécanismes de fusion membranaire en utilisant les rhabdovirus et leur glycoprotéine en tant que système modèle. Nous avons déjà caractérisé deux structures de la glycoprotéine du virus de la stomatite vésicul
Propagation d’un repliement amyloïde comme mode de transmission du signal d’une protéine STAND à une protéine prion – STANDPRION
Il s'agit d'établir et d'étudier dans un modèle fongique, l'existence d'une interaction fonctionnelle entre des protéines de type STAND et leur domaine effecteur. L'activation du domaine effecteur se fait par la propagation de la protéine STAND vers le domaine effecteur d'un repliement amyloide, qui
Relation structure-propriétés des agrégats protéiques impliqués dans les maladies neurodégénératives de Parkinson et Huntington – STRUCTOXIC
Nous cherchons à documenter les propriétés structurales des assemblages de protéines impliquées dans la maladie de Parkinson. Cette maladie comme celle d'Alzheimer et de Huntington ont un cout pour une société vieillissante. (Les partenaires sont anglophones) After sequential assignments of an alph
Etude integrative de la fonction du Médiateur dans la regulation de la transcription. – IntegraMed
Le projet IntégraMed vise à comprendre comment une molécule complexe, le Médiateur de la transcription, contrôle l’expression des gènes en situation normale ou dans des pathologies telles que les cancers ou des maladies congénitales touchant le développement. La régulation de la transcription con
Structures, mecanismes, et conception d’inhibiteurs des protéines L des Bunyavirus et Arenavirus – ArenaBunya-L
Notre but est la détermination de la structure atomique de la polymérases pour comprendre les mécanismes de transcription et réplication de l'ARN virale. Les résultats préliminaires sur l’identification des domaines à exprimer, ou la production de protéine L complète de bunyavirus pour de la microsc
Impacts de la transcription par l’ARN polymérase II sur l’assemblage de l’EJC – EJCbirth
L’EJC (Exon Junction Complex) est assemblé sur les ARN messagers (ARNm) lors de la réaction d’épissage 24nt en amont de la jonction exon-exon. La liaison de l’EJC est cruciale pour le devenir des mRNPs : l’export, la traduction et la stabilité des ARNm peuvent être affectés par la présence ou l’abse
Tolérance des lésions de l'ADN – ForkRepair
Le génome de tout organisme vivant est continuellement endommagé par des agents endogènes (mécanismes oxydatifs,…) ou par des agents exogènes chimiques (fumée de cigarette,….) ou physique (rayonnement solaire). Les mutations sont des changements irréversibles du message génétique qui s’induisent lor
Organisation et dynamique des centrioles et cils – CCOD
Les centrioles (dans le centrosome) et les corps basaux (dans les cils et les flagelles) sont des systèmes similaires qui jouent des rôles essentiels dans la division de la cellule et sa motilité. La dérégulation de la duplication des centrioles est liée à la formation de tumeurs. De même, des altér
La machinerie Hsp90-R2TP et l’assemblage de complexes macromoléculaires : rôle dans la biogenèse des RNP. – Hsp90assembly.com
Le chaperon moléculaire Hsp90 et son complexe cochaperon R2TP forment un système d’assemblage et de maturation de machines moléculaires d’une grande complexité qui sont essentielles à la vie de la cellule. Pour éclaircir le mode d’action du système Hsp90-R2TP, nous analyserons son architecture et l
Métabolisme de l’ARNm et expression génétique chez Bacillus subtilis : une étude fonctionnelle et structurale des deux nouvelles ribonucléases Y et J – RNAJAY
Les protéines sont synthétisées à partir d’acides aminés en prenant pour matrice des molécules d’ARNm (Acides RiboNucléiques messagers) lors d’un processus appelé « la traduction ». Ces ARNm représentent des copies des gènes (ADN) qui codent pour ces protéines. Mais contrairement à l’ADN qui est trè
Messagers dont l’Initiation de la Traduction Interne est dirigée par la Coiffe – MITIC
Nous avons récemment montré que la traduction de l’histone H4 est initiée par un mécanisme original, reprenant à la fois certaines caractéristiques cellulaires (présence d’une coiffe) et virales (absence de « scanning » et entrée interne des ribosomes). Contrairement aux ARN messagers classiques, la
Etude structurale et fonctionnelle du complexe polymérase du virus respiratoire syncytial et recherche d’inhibiteurs – BRONCHIOLITEASER
Le virus respiratoire syncytial (VRS) est le principal agent responsable des pneumonies et bronchiolites chez le nouveau-né ainsi que chez le veau. Il n'existe pas de vaccin à ce jour pour l'homme et les antiviraux restent à développer. Ce projet vise à mieux caractériser au niveau structural et fon
Relations structure-fonction des récepteurs à l’acide rétinoïque, du génomique à l'échelle atomique – RAR-SCALES
L’objectif de ce projet est d’identifier à l’échelle génomique la fixation des RARs et RXRs durant la différentiation cellulaire, de caractériser les éléments de réponse non canoniques et de déterminer si la séquence primaire et l’organisation des éléments de réponse de RARs contrôlent de façon allo
Bases moléculaires de la reprogrammation post-méiotique du génome mâle – EpiSperm2
Chez les mammifères la réorganisation post-méiotique du génome mâle et sa compaction peuvent sur un plan conceptuel être considérées comme similaire à la sporulation chez les eucaryotes inférieurs et à la formation du pollen chez les plantes. En effet dans tous les cas l’objectif est de préparer le
Régulation de l'épissage alternatif par la machinerie du RNAi – iSPLICE
Dans le cytoplasme, les protéines Argonautes (AGO) sont associés au complexe RISC et utilisent de petits AN pour cibler des ARN messagers et ainsi induire leur dégradation ou inhiber leur traduction. Dans le noyau, nous trouvons que ces protéines sont associés à des facteurs d’épissage. Nos données
Contrôle de la prolifération cellulaire et de la stabilité génétique par les enzymes p400 et Tip60 – PinGS
L’objectif du projet est d’étudier le rôle de p400 et Tip60 dans la prolifération cellulaire et le maintien de l’information génétique, deux processus qui sont défectueux dans les cancers. L’implication de ces deux protéines dans la formation de cancers sera également testée. Nous avons montré que l
Evenements d'ubiquitination et de dé-ubiquitination dans la régulation de la réplication virale – Ubi-or-not-Ubi
. . . . Le fonctionnement cellulaire est finement régulé grâce à des processus sophistiqués, aux premiers rangs desquels figurent les modifications post-traductionnelles des protéines. Récemment, l'ubiquitination des protéines et leur dégradation par le protéasome s'est révélé être un processus maje
Structure, dynamique et mécanisme d’Arpin, un nouvel inhibiteur du complexe Arp2/3 qui contrôle la migration cellulaire – Dynarpin
Une cellule en migration est propulsée par la polymérisation, à l’intérieur de la cellule, d’un réseau de protéines, composé d’actine. Il s’agit d’un processus extrêmement complexe et hautement régulé. Nous avons entrepris d’en décortiquer un aspect encore mal connu, qui est le phénomène de dépolymé
Mécanisme de clivage de la coiffe des ARNm eucaryotes – Decapping
Les ARNm eucaryotes matures sont protégés d’une dégradation rapide et non régulée dans le cytoplasme par deux éléments stabilisateurs: une coiffe et une queue poly(A), respectivement au niveau des extrémités 5’ et 3’ des ARNm. La dégradation des ARNm nécessite donc un remodelage conséquent de la str
Télomères et chromosomes dicentriques – TELO&DICENs