Relations entre diversité procaryotique et virale au sein de différents environnements aquatiques – AQUAPHAGE

Les virus constituent l'entité biologique la plus abondante des écosystèmes aquatiques. Il est aujourd'hui reconnu que leur rôle puisse être essentiel dans le contrôle de la diversité des organismes procaryotes. Cependant, l'étude des phages à l'échelle des communautés naturelles reste limitée. C'est dans ce cadre scientifique que se situent les objectifs spécifiques d'AQUAPHAGE:
1) déterminer l'effet des virus (par comparaison avec celui des prédateurs) sur la dynamique et la biodiversité des procaryotes ;
2) relier la nature du cycle de vie (cycles lysogénique vs. lytique) à la diversité des phages ;
3) valider le modèle mathématique dit du « phage kills the winner », entre autres ;
4) conduire des expériences in situ de co-variation entre biodiversité virale et biodiversité des hôtes. La mise en oeuvre d'approches métagénomiques permettra de tester la robustesse du modèle cité.
Les études seront menées dans des environnements aquatiques contrastés (approche écologique comparative), ce qui permettra de relier biodiversité virale et productivité des écosystèmes.