Projets financés
REGARD SUR L’AUTOPHAGIE MÉDIÉE PAR LES CHAPERONES CHEZ LES POISSONS – Fish-and-Chap
Dans ce contexte, nous proposons de définir pour la première fois si l’apparition de cette fonction est antérieure à celle des mammifères et des oiseaux, et de déterminer le rôle physiologique de l’homologue de la protéine LAMP2A identifiée chez les poissons. Notre stratégie repose sur deux approche
Alternance du mode de reproduction : parts de la génétique et de l’environnement – SexAphid
S’adapter à son environnement est essentiel à chaque type d’organisme vivant, à la fois sur le court terme pour permettre la survie de l’individu, et sur le long terme pour assurer la perpétuation de l’espèce. Une adaptation à l’environnement implique une flexibilité : sur le court terme il s‘agit d
Paléogénomique de la domestication des bovins pour enrichir les stratégies durables de sélection – PATH2BOS
Le séquençage d'une trentaine de génomes bovins anciens permettra une comparaison avec une abondante base de données génomiques et phénotypiques de bœufs modernes pour reconstruire les pressions sélectives s’opérant aux différentes phases préhistoriques et historiques de la domestication. Les génome
Identification, mode d’action et synthèse des composés inducteurs des réponses immunitaires et antifongiques et d’une souche bactérienne utilisée pour la protection des plantes – STREPTOCONTROL
Les Streptomycètes sont des bactéries du sol retrouvées dans une large diversité d'habitats naturels et en particulier au niveau de la rhizosphère, une zone à proximité immédiate des racines des plantes. Ces microorganismes sont caractérisés par leur capacité à produire une immense diversité de méta
Pathogénie moléculaire chez Flavobacterium psychrophilum, bactérie pathogène de poissons. – FlavoPatho
Face à l’augmentation de la population mondiale, nourrir la planète de manière durable est un défi majeur. L’aquaculture, secteur en pleine expansion, est une filière d’avenir car elle produit des nutriments sains tout en stimulant le commerce local et en préservant les stocks naturels de poissons.
Vers la comprehension du controle epigenetique du determinisme du sexe chez les cucurbitaceae – EPISEX
Comment le sexe d’une fleur ou d’une plante est contrôlée est une question centrale de la biologie du développement chez les plantes. Comprendre ce processus a également d’importantes implications pratiques en agriculture et en sélection des plantes, dans la mesure où le sexe des fleurs et des plant
Etablissement de lignées cellulaires de ruminants pour la réplication et l'étude de pathogènes – EpiLungCell
Les poumons sont constamment exposés à l'environnement externe et aux agents infectieux et toxiques présents dans l'air. Les pathogènes viraux et bactériens induisent des dommages aux cellules épithéliales du poumon conduisant à l'altération de la fonction respiratoire et dans certains cas à une mal
Interaction plante-pathogène: influence de la température et contribution de la signalisation calcium – CaPPTure
Le scenario actuel du réchauffement climatique prévoit pour les plantes, une augmentation du nombre d’épidémies liées à la multiplication des pathogènes dans de nouvelles zones géographiques. Cette expansion des maladies représente une menace importante pour la production végétale en causant des per
VAlorisation de Métabolites secondaires bactériens en AGronomie et en PHARmaceutique – VAMAGPHAR
Dans l'agronomie, le nombre croissant de rapports dans le domaine des interactions plantes-bactéries-champignons fournit de plus en plus de connaissances sur la nature et la fonction des communautés microbiennes de la rhizosphère. Ces interactions plantes-microorganismes peuvent être, en grande part
Compromis dans les symbioses rhizobium-légumineuse, influence de l’immunité et des défenses sur la symbiose et vice versa – TrolesInfidels
En s’associant avec des bactéries du sol appelées rhizobia, les plantes de la famille des légumineuses sont capables de se développer sur des sols pauvres en azote. Durant ces interactions, les plantes profitent de la capacité des rhizobia à fixer l’azote atmosphérique. Les métabolites fournit par l
Amélioration de l'amidon de pomme de terre in vivo pour les filières agrosourcées émergentes – TaPStar
L’amidon est une forme de stockage d’énergie carbonée chez les végétaux et la principale source de calories dans les alimentations humaine et animale. Ce polymère est en outre utilisé dans l’industrie agroalimentaire et non-agroalimentaire. L’amidon est devenu une ressource importante pour la produc
SuccEssion des Ensembles microbiens lors du Développement des Semences – SEEDS
Les graines sont impliquées dans la transmission de micro-organismes du porte-graine à sa descendance et constituent donc la source d’inoculum primaire pour le microbiote des plantes. Certains micro-organismes associées aux semences peuvent avoir un rôle délétère ou bénéfique pour la fitness de la p
Criblage fonctionnel des loci impliqués dans la dégradation des polysaccharides marins – PULmarin
Les polysaccharides marins représentent la biomasse marine la plus abondante et la plus diverse. Ces macromolécules sont biosynthétisées par les organismes photosynthétiques (e.g. algues, micro-algues, cyanobactéries) et constituent une source d’aliment pour les organismes hétérotrophes. A l’excepti
Comprendre les mécanismes de régulation et la fonction des gènes de la réponse immunitaire de l'hôte pour perturber la symbiose et le contrôle des endosymbiotes chez les insectes nuisibles – GREEN
La plupart des insectes nuisibles exploitant des milieux nutritionnellement déséquilibrés vivent en association symbiotique avec des bactéries intracellulaires (endosymbiotes) qui complètent leur alimentation, améliorant ainsi leurs pouvoirs adaptatif et invasif. Ces bactéries, transmises maternelle
Etude des mécanismes et implications physiologiques d’une voie de surveillance de l’intégrité polyvalente des barrières apoplastiques. – MIND-THE-GAP
Les barrières de diffusion extracellulaires sont essentielles à la survie des plantes et à leur résistance au stress. La majeure partie de la surface terrestre a été colonisée par les plantes. La colonisation de biotopes terrestres par des organismes photo-synthétiques d’origine aquatique a nécessit
Mécanismes moléculaires contrôlant la balance entre croissance et défenses chez les plantes, et influence du réchauffement climatique – BUGSTER
Les plantes doivent croître suffisamment rapidement pour rivaliser avec leurs voisins, et résister aux agressions permanentes d’agents pathogènes. Plutôt que d'arrêter leur croissance pour se défendre, les plantes établissent souvent un équilibre entre croissance et défense, afin de satisfaire des d
Contribution des éléments transposables (ET) à la domestication et à l’amélioration de la tomate – tomaTE
Nous souhaitons exploiter l'expertise complémentaire du partenaire 1 dans les études épi)génomiques des ET chez l'espèce modèle Arabidopsis et du partenaire 2 en génétique fonctionnelle de la tomate pour évaluer la contribution de la mobilisation des ET à la domestication et à l'amélioration de la t
Traits racinaires pour l'adaptation du mil au climat futur en Afrique de l'Ouest – RootAdapt
La production de céréales per capita en Afrique de l'Ouest est en baisse du fait de la forte croissance démographique qui surpasse l'augmentation de production. De plus, la plupart des modèles prédisent que les changements globaux vont entrainer une baisse de rendement des céréales telles que le sor
Dissection moléculaire de la réponse au Nitrate chez les Céréales – NiCe
Le nitrate (NO3-) est la principale source d’azote (N) pour les plantes herbacées. Il agit aussi comme molécule-signal régulant l’expression de centaines de gènes, dont des acteurs de son assimilation et du métabolisme primaire. Cette Réponse Primaire au Nitrate (PNR) a principalement été étudiée ch
Lecture de l'épitranscriptome du stress thermique chez Arabidopsis – HEAT-EpiRNA
Dans un contexte de réchauffement climatique, les plantes doivent affronter de plus en plus souvent des conditions environnementales défavorables à leur croissance et à leur développement. Leur réponse aux stress environnementaux implique de nombreux systèmes de perception et de signalisation induis
Rôle des modifications épigénétiques chez un pathogène de plante au cours de l’adaptation à l’hôte et des changements d’hôte – EPI-PATH
La méthylation de l’ADN est l’un des mécanismes épigénétiques à l’origine de l’hétérogénéité des phénotypes chez les bactéries. Ce phénomène contribue à l’altération de l’expression des gènes sans modifier la séquence d’ADN. La méthylation de l’ADN est la forme la plus commune des modifications d’AD
Déchiffrer le code olfactif des abeilles : de la communication sexuelle aux comportements sociaux – Bee-o-CHOC
L'abeille Apis mellifera est le pollinisateur le plus important pour l'agriculture dans le monde. Son service de pollinisation est gravement menacé par les pertes de colonies, qui ont considérablement augmenté récemment. Pour promouvoir et maintenir la santé et la diversité génétique de nos populati
Impact de la dynamique des télomères sur la croissance chez l’algue verte unicellulaire modèle Chlamydomonas reinhardtii – AlgaTelo
Les algues photosynthétiques occupent une place centrale en recherche fondamentale et appliquée par leur rôle clé de fixation de carbone et d'évolution d'oxygène et par leur utilisation accrue en biotechnologie pour la production de biofuels (dans un contexte d’épuisement irréversible des combustibl
Séquences virales endogènes: rôle dans l’évolution des virus et fonctions chez les plantes – EVENTS
Les séquences virales endogènes (EVE) sont des séquences nucléiques d’origine virale qui se sont intégrées dans le génome de leurs hôtes par des mécanismes de transfert de gène horizontal (HGT) passif ou actif. La majorité des EVE connues chez les plantes est issue de virus à génome ADN des familles
Découverte de la relation entre épigénétique et symbiose chez l'insecte – Unleash
Les charançons sont des pestes agronomiques importantes, capables de survivre sur un milieu pauvre en nutriment grâce à leur collaboration avec une bactérie endosymbiotique. Comprendre le dialogue moléculaire entre l’hôte et l’endosymbionte pourrait permettre une meilleure prise en charge des milieu
Rôle du cycle cellulaire bactérien dans la fixation symbiotique d’azote chez les Légumineuses – SymbiontCellCyc
Nous cherchons à comprendre et à exploiter le rôle crucial mais encore mal connu des régulateurs du cycle cellulaire de la bactérie symbiotique Sinorhizobium meliloti au cours de la symbiose fixatrice d’azote avec des plantes Légumineuses du genre Medicago. Les plantes légumineuses peuvent établir u
Dynamique de la sécrétion de coumarines dans le sol, un processus développé par les plantes pour améliorer la nutrition en fer – MOBIFER
Le Fer (Fe) est un micronutriment essentiel pour la productivité des plantes ainsi que pour la qualité de leurs produits dérivés. Cependant le Fe est généralement peu disponible pour les plantes car il est principalement présent dans le sol sous forme de chélates insolubles. Nous avons, ainsi que d’
Découverte de réseaux moléculaires symbiotiques chez les plantes par des approches basée sur l'évolution – EVOLSYM
L’acquisition de nutriments tels que l’azote et le phosphore est une contrainte majeure en agriculture, résultant en une augmentation significative de l’utilisation d’engrais chimique. La production de ces engrais dépend de réactions couteuses en énergie fossile. Il est aujourd’hui critique de trouv
Induction des réponses pathogenesis-related par le fort CO2 chez les plantes: signalisation, voies métaboliques, et impact agronomique – HIPATH
Malgré l’impact préoccupant du changement climatique sur les productions végétales, les connaissances disponibles sur les conséquences d’un taux accru de CO2 sur les maladies des plantes cultivées sont fragmentaires. Nous avons récemment établi qu’un fort taux de CO2 induit à lui seul des réponses d
Analyse du remodelage de la paroi végétale par analyses mécaniques et modèles biomimétiques – WALLMIME
La paroi primaire végétale est une structure complexe formée de protéines et de polysaccharides. Elle joue un rôle majeur dans la croissance des plantes et, de fait, la production de biomasse. Les pectines sont l’un des composants majeurs de la paroi primaire végétale, représentant jusqu’à un tiers
Gènes à expression sexuellement dimorphique et développement précoce chez le bovin: impact de l'environnement – BosexDim
L'embryon aux premiers stades de développement est très sensible aux perturbations de son environnement, qui engendrent à l'âge adulte des modifications phénotypiques différentes selon le sexe. Ceci suppose l'existence de différences sexe spécifiques très précoces. De telles différences, antérieures
Déterminants épigénétiques et biochimiques de la biogenèse des siARN nucléaires chez Arabidopsis – Epi_siRNA_biogen
Cells have RNA-directed mechanisms to destroy viruses, silence transposons and regulate genes. Such “RNA silencing” systems rely upon selective base pairing of small interfering RNAs (siRNAs) to complementary RNA targets. RNA silencing targets specific mRNAs for translational inhibition, cleaves tra
Détermination de gènes régulateurs maîtres du développement des racines coronaires pour l’ingénierie de la tolérance au déficit hydrique des céréales. – MASTEROOT
Il existe dans le monde une demande croissante pour des variétés de céréales capables de maintenir leur rendement malgré des ressources du sol limitées. En 2012 les principales entreprises de sélection ont mis sur le marché des lignées de maïs améliorées pour leur résistance à la sécheresse. Elles o
Comment l'ubiquitination permet à LEAFY de créer les fleurs – UbiFlor
La fleur assure une reproduction efficace des angiospermes et fournit fruits et graines. Le facteur de transcription LEAFY est le régulateur clé du développement des fleurs. Son activité dépend de son interaction physique avec l’ubiquitine ligase UFO, mais la raison de cette dépendance est inconnue.