Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique

France Génomique (FG) est une infrastructure distribuée de génomique dotée d'une expertise de pointe dans le domaine du séquençage de l'ADN à très haut débit et de l'informatique pour la génomique. Elle est constituée d'un noyau central de 13 plateformes, ainsi que de 22 plateformes de séquençage ou bioinformatiques associées. FG bénéficie d'une infrastructure informatique centrale (CCRT de Bruyères le Chatel) et utilise également les ressources de plusieurs mésocentres (avec l’IFB).

FG met à la disposition de la communauté son portefeuille d’expertises de 173 applications génomiques différentes grâce à des instruments de séquençage de pointe. 2023 a vu l'émergence de nouvelles générations d'instruments, permettant de réduire les coûts de séquençage de 50 à 80%.

Les actions du projet sont : i) de réaliser collectivement et de mutualiser une veille technologique, d’évaluer le potentiel et l’intérêt de nouveaux instruments, ii) de cofinancer des développements technologiques et méthodologiques, iii) d’améliorer la compétitivité des plateformes en négociant globalement avec les fournisseurs principaux, iv) de suivre précisément grâce à un système d’information global l’activité de l’ensemble des plateformes et son évolution, v) de renforcer l’expertise de la communauté des ingénieurs des plateformes via diverses actions (rencontres, visites, forum d’échange, organisation de colloques scientifiques), vi) d’anticiper autant que possible l’évolution des besoins de la communauté scientifique, vii) pouvoir financer un appel à projets risqués, considérant que le financement dans le cadre mutualisé de l’infrastructure est le cadre le plus pertinent pour réaliser ces projets risqués et tirer collectivement partie de l’expertise unique ainsi acquise.