Modèle isolement-migration de l’histoire des communautés de poissons des récifs coralliens : théorie et données – IM-MODEL@CORALFISH

La distribution de la diversité moléculaire peut contenir toutes les informations pour permettre de reconstituer l'histoire des populations sur des milliers de générations. Le fait que les différents marqueurs moléculaires (microsatellites, sequences d'ADN) ont des taux de mutation très variable a souvent été perçu comme une limitation aux analyses génétiques. Mais en fait, cela peut être également vu comme un moyen d'obtenir des estimations plus précises, en utilisant les différents types d'informations à la fois. Le principal objectif développé dans IM-MODEL@ CoralFish est de mettre au point un modèle base sur un maximum de vraisemblance et qui s’intéresse aux populations structurées dans le but d'estimer le temps et l'isolement réciproque entre les taux de migration des populations. La partie théorique de ce projet consistera à développer un modèle de maximum de vraisemblance à six paramètres en populations structurées pour estimer la durée d'isolement et les taux de migration entre paires de populations en situation de non-équilibre. Ce modèle est plus proche des conditions biologiques naturelles que tous les logiciels disponibles actuellement. Ce modèle sera développé dans les récifs coralliens des collectivités territoriales françaises qui offrent la meilleure étude de cas en termes de diversité biologique et de documentation historiques. Nous allons donc analyser la variation moléculaire pour onze espèces de poissons provenant de quatre zones géographiques (la Réunion, Wallis, Nouvelle-Calédonie, Polynésie française). L’application du nouveau modèle théorique fournira de nouvelles information’s sur l'histoire des écosystèmes de récifs coralliens depuis la dernière période glaciaire, au cours de laquelle des changements dans la température, du niveau de la mer, les courants océaniques et ont considérablement affecté la biologie des populations des récifs. Ces résultats permettront une meilleure évaluation de la réponse des écosystèmes et des récifs aux changements climatiques, et de sa capacité de résilience. Notre projet fournira un cadre général pour l'application de la nouvelle modélisation en génétique des populations.