– TRANSPORTOME

Les processus physiologiques impliqués dans la croissance et le développement des plantes ainsi que dans l’adaptation aux fluctuations environnementales mettent fréquemment en jeu des flux massifs d’ions et/ou des signaux électriques. Ainsi, la perception, la transduction et l’interprétation des signaux chez les plantes font intervenir des récepteurs, des pompes et des canaux ioniques. Les analyses électrophysiologiques in vivo ont révélé l'existence d'une grande variété de systèmes de transport ioniques se distinguant parleur localisation tissulaire et sub-cellulaire et par leurs caractéristiques fonctionnelles (activation par le voltage, l'étirement de la membrane et/ou des ligands; perméabilité aux anions ou aux cations, faible sélectivité vis-à-vis d'une catégorie d'ions donnée ou forte sélectivité pour un seul ion, etc.). En regard des données fonctionnelles in vivo, les connaissances au niveau moléculaire sont très réduites. En pratique, la plupart des canaux caractérisés à ce niveau sont des canaux régulés par le voltage, très sélectifs du potassium, appartenant à la famille Shaker . L’analyse systématique du protéome de la membrane plasmique d’Arabidopsis thaliana (400 protéines orphelines de fonction identifiées à ce jour) offre l'opportunité d'identifier de nouveaux gènes codant des systèmes de transport ou des partenaires de complexes macromoléculaires impliquant ces systèmes. Pour cela, nous proposons (1) un criblage systématique des ADNc codant des protéines de fonction inconnue dans des systèmes d'expression hétérologue propres à révéler (techniques électrophysiologiques) des propriétés de transport ionique (ovocytes de Xénope, cellules COS) (2) l'identification de partenaires par une technique (DHFR) de semi-haut debit), (3) la recherche des transporteurs impliqués dans des réponses à des stress abiotiques par une approche génétique. Ce programme permettra d'identifier au niveau moléculaire des systèmes de transport spécifiques des plantes. Ces connaissances pourront être utilisées dans les programmes d'amélioration génétique visant à obtenir des variétés permettant de réduire les intrants dans la production agricole.